בהליך לקיחת המשכנתא חוץ מתשלום המשכנתא בפועל ישנן אגרות שונות שיש לשלם והן מועמסות על לוקחי המשכנתא, כמו: אגרות רישום לטאבו, רשת המשכנות, אגרות לעיריה וכו'.